FSC森林認證的效益主要表現在三個方面：環境效益、社會效益和經濟效益。

1、環境效益

保護生物多樣性及其價值、水資源、土壤、獨特而脆弱的生態系統和自然景觀等；

維持森林的生態功能和生態系統的完整性，促進森林的可持續經營；

保護瀕危物種及其生境。

2、社會效益：確保所有利益各方的權利得到尊重和實現。

3、經濟效益

提高森林生產力；

穩定森林經營權；

確保木材的長期供應；

加強企業的基礎管理和環境管理；

保持或增加市場份額；

改善與各利益方的關系；

產品溢價；

加強與管理者的聯系，獲得森林經營的優先權；

生產有差別產品；

提高職員的士氣和能力，吸引人才；

提高企業產品在國際市場上的競爭能力和信譽；

獲取更多的財政和技術支持。

FSC森林認證有兩種費用：直接費用即認證本身的費用和間接費用即為滿足認證要求，森林經營單位在提高管理水平、調整經營規劃、培訓員工等方面所支付的費用。多數情況下，后者比前者更高。

1、直接費用

直接費用又稱固定費用，它包括：森林評估和審計費用；年度審計費用。

影響因素有：認證機構評估的可行性；認證實施的難易程度和規模；森林經營單位管理體制的效果和透明度；森林經營單位的大小、管理結構的復雜程度、生物多樣性的豐富程度、社會環境的多樣性以及有關活動記錄的清晰程度。一般來說，熱帶雨林的認證費用要高于溫帶林，天然林的認證費用要高于人工林。

2、間接費用

間接費用又稱可變費用，它與認證單位實施的森林經營體系質量有關。良好的森林經營體系就不必對現有的森林經營長遠規劃、森林作業操作規程做大的調整，也不必為培訓、森林經營等進行更大的投入，從而減少為通過認證而在這些方面所支付的費用。

認證費用與認證森林的規模相關。在同等經營水平下，規模小的森林比規模大的森林的認證費用要高。